O Reino Fungi possui organismos bastante diversos e de importância ecológica, econômica e também na área da saúde. No ambiente, os fungos participam de importantes processos como a decomposição da matéria, transporte de nutrientes, além de se associarem a outros organismos. Em relação às plantas, podem ser benéficos, como os fungos micorrízicos, ou causar doenças. Ainda na área ambientais podemos citar os benefícios alcançados quando se utiliza fungos no controle biológico das pragas que atacam os vegetais. Além disso, os fungos contribuem ainda com a biorremediação de áreas contaminadas uma vez possuem capacidade de metabolizar elementos tóxicos. Apenas cerca de 5% do número de estimado de espécies fúngicas está descrita, provavelmente devido a limitações de cultivo, habitats ainda não explorados e problemas nas identificações em coleções de culturas. Com o advento da biologia molecular, o número de espécies conhecidas vem aumentando, assim como se tem investigado e obtido mais informações a respeito da biologia dos fungos. Objetiva-se com este projeto investigar e identificar fungos em diferentes biomas; caracterizá-los morfológica e molecularmente. Focaremos em estudos envolvendo a associação fungos micorrízicos-plantas, um processo com ocorrência natural em 70-90% das espécies vegetais e fungos macroscópicos lignolíticos, com o desenvolvimento de novas tecnologias de sequenciamento como o Nanopore Oxford®.