Orientador(es): ANA TERESA NOGUEIRA DUMANS
Área temática: BIODIVERSIDADE
Modalidade de apresentação: SESSÃO DE PÔSTER
Bolsa: IC/UNIRIO
O genoma mitocondrial possui propriedades únicas, como ausência de recombinação e taxa mais rápida de mutação. Essas propriedades tornam seu uso útil para estudos de filogenia, em especial para a resolução de questões taxonômicas em espécies morfologicamente semelhantes, como as da família Sarcophagidae e do gênero Sarcophaga. O objetivo deste estudo é a montagem e anotação do mitogenoma da espécie S. bullata a partir de dados públicos e a utilização do mesmo para estudos filogenéticos. A montagem foi realizada com os programas NOVOPlasty e MITObim. O resultado foi submetido ao programa Tablet, a fim de verificar a circularização e a cobertura da montagem. A anotação gênica foi conduzida no servidor MITOS e curada com o auxílio do programa Artemis. Os genes COXI de 68 espécies, obtidos do GenBank, foram alinhados com o de S. bullata. Destas espécies, 64 pertenciam à família Sarcophagidae, sendo 50 do gênero Sarcophaga. Quanto aos subgêneros de Sarcophaga, 7 possuíam apenas um representante e 13 possuíam duas ou mais espécies. O grupo externo foi representado por 5 espécies de Calliphoridae. Os alinhamentos foram executados com o programa MAFFT e otimizados com o MACSE. A árvore filogenética de Máxima Verossimilhança foi obtida com o IQTree sob o modelo evolutivo GTR+I+G4+F obtido pelo ModelFinder e bootstrap de 5000 réplicas. A montagem resultou em um mitogenoma completo de 15.720 pb. Através da anotação foram localizados os 22 tRNAs, 13 PCGs, 2 rRNAs e uma região de controle, como esperado. O conteúdo A+T de 75.7%, característico de mitogenomas, foi observado. Os códons ATT e ATG foram os iniciadores de tradução de 10 dos 13 PCGs, mas também foram observados os códons GTG, TTG e TCG. A trinca TAA foi observada como códon de parada em 8 dos 13 PCGs. Os demais genes apresentaram a terminação T, comum em mitogenomas. A árvore filogenética sustentou o monofiletismo da família Sarcophagidae. Apesar do gênero Sarcophaga ter seu monofiletismo bem suportado, neste trabalho não foi recuperado como monofilético devido ao posicionamento da espécie S. pauciseta, que se agrupou com o gênero Blaesoxipha. Como relatado em estudo anterior, esse resultado pode ser consequência de um possível erro de identificação, sendo o mitogenoma de S. pauciseta disponível no banco de dados RefSeq, pertencente a outra espécie, o que, se confirmado, preservaria o monofiletismo do gênero Sarcophaga. O monofiletismo dos subgêneros Sarcophaga, Bercaea, Neobellieria, Thyrsocnema, Belleriomima, Boettcherisca e Liopygia foi observado, enquanto que 6 subgêneros foram recuperados como não monofiléticos. Tal análise não pôde ser realizada para 7 subgêneros devido ao fato de serem representados por apenas uma espécie. Este trabalho apresenta, pela primeira vez, o mitogenoma completo de S. bullata. As análises foram condizentes com as observadas na literatura. A filogenia baseada no gene COXI, ampliou a amostragem, em comparação com nossos estudos baseados em concatenados gênicos.
CAMERON, S. L. et al. A mitochondrial genome phylogeny of Diptera: Whole genome sequence data accurately resolve relationships over broad timescales with high precision. Systematic Entomology, v. 32, n. 1, 2007. SHANG, J. et al. Comparative Mitogenomics of Flesh Flies: Implications for Phylogeny. Insects, v. 13, n. 8, 2022. ZHANG, D. et al. PhyloSuite: An integrated and scalable desktop platform for streamlined molecular sequence data management and evolutionary phylogenetics studies. Molecular Ecology Resources, v. 20, n. 1, 2020.